Il Trypanosoma cruzi, agente eziologico della malattia di Chagas, è ampiamente diffuso nel continente americano. Attraverso diverse tecniche di biologia molecolare, è stato osservato un chiaro dimorfismo tra gli isolati, che ha portato al raggruppamento dei ceppi in due grandi linee filogenetiche: T.cruzi I (correlato a ZI) e T.cruzi II (correlato a ZII). Un dendrogramma filogenetico basato su alcuni target genomici ha rivelato una chiara dicotomia in ZIII, definendo due sottogruppi (ZIII-A e ZIII-B). Pertanto, l'analisi proteomica dei ceppi appartenenti a ZIII rispetto a T. cruzi I e II può contribuire a chiarire questa questione. Questo lavoro ha come obiettivo principale definire la mappa delle proteine solubili dei ceppi appartenenti al zimodema III (3663 - ZIII-A e 4167 - ZIII-B), sottolineando le differenze esistenti tra i sottogruppi ZIII-A e ZII-B. I risultati definiscono la mappa proteomica e la classificazione di alcune proteine degli isolati ZIII considerando i sottogruppi genomici circolanti in natura.