Culturas Ancestrales narra la historia de amor prohibido entre Alejandro y Atziri, el cual se da en medio de una conspiración egipcia que busca derrocar al emperador maya, quien es el líder de todas estas culturas milenarias, tales como chinos, celtas, druidas, romanos, aztecas, incas, entre muchas otras más que permanecen ocultas para la sociedad en pleno siglo XXI.
Protagonizando así batallas épicas entre humanos superdotados que pelean por sus emperadores y por sus pueblos, al mismo tiempo que intentan no ser descubiertos por los denominados "modernos", gente común y corriente como Atziri, una hermosa joven arqueóloga mexicana que se enamora del príncipe Maya, Alejandro, cuando sucede un atentado contra su vida.