Istnieje wiele czynników odpowiedzialnych za straty pozbiorcze powyższych owoców, a jednym z nich są mikroorganizmy zdolne do rozwoju chorób owoców. Utajone infekcje, takie jak Citrus Leaf Miner (powodowany przez Phyllocnistis citrella - szkodnik), Citrus White Fly / Citrus Black Fly (Dialeurodes citri; Aleurocanthus woglumi - owad), Citrus lub Lemon Butterfly (Papilio demoleus - szkodnik w szkólkach), Citrus Mite (Eutetranychus orientalis - owad), Armoured scales (Aonidiella auriantii, A. citrina, A. orientalis, Chrysompahlus aonidum), miękkie luski (Coccus hesperidium, C. viridis) i mszyce (wywolywane przez Toxoptera citricida - wirus) są dominującymi chorobami pożniwnymi, które powodują poważne straty pożniwne i wplywają na jakośc owoców w lańcuchu dostaw. Owoce nie tylko przenoszą florę bakteryjną, ale także zwiększają swoją silę podczas przechodzenia z gospodarstwa na stól.