Oggi, grazie al miglioramento delle capacità dei computer, la modellazione molecolare è diventata una tecnica potente nella chimica computazionale con interessi pratici sempre crescenti. Attualmente, l'utilizzo di algoritmi efficaci e di potenti processori ci consente di simulare sistemi che comprendono migliaia di atomi per diversi microsecondi. Tuttavia, trovare un equilibrio tra i costi di calcolo e l'affidabilità dei risultati rimane ancora una sfida. Due approcci generali ci aiutano a rivelare il comportamento di questi sistemi: la meccanica quantistica e i calcoli di dinamica molecolare. La dinamica molecolare (MD) studia il moto di un insieme di atomi, molecole o particelle che interagiscono tra loro. La MD è in grado di estrarre osservabili sperimentali dalla dinamica del sistema studiando il moto del sistema stesso.